В ispmanager можно включить возможность обработки PHP-скриптов для сайта. Для этого при создании или изменении WWW-домена включите опцию PHP и настройте его параметры. Подробнее см. в статье Создание WWW-домена.

Поддерживаемые Режимы работы PHP.

Подробнее о возможностях настройки PHP для режимов работы см. в статье Настройка PHP в CloudLinux.